23–25 Sept 2024
SUB Göttingen - Historisches Gebäude
Europe/Zurich timezone

Erfolge von Datenmanagement im Bereich der Sequenzierung

25 Sept 2024, 10:00
15m
Alfred-Hessel-Saal (SUB Göttingen - Historisches Gebäude)

Alfred-Hessel-Saal

SUB Göttingen - Historisches Gebäude

Papendiek 14, 37073 Göttingen
Presentation Diverse Themen

Speaker

Danuta Schüler (Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) Gatersleben)

Description

Ein Schwerpunkt des Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) ist die Erschließung und Bewahrung pflanzengenetischer Ressourcen. Damit verbundenen Datenmanagementprozesse werden in einem Laborinformationsmanagementsystem umgesetzt. Hier werden Labor-Serviceprozess mit Datenerhebungen in Forschungsprojekten nach FAIR-Kriterien zu gemeinsamen Prozessen zusammengeführt. Dazu gehört u.a. die Hochdurchsatz-Sequenzierung. Im Vortrag werden Lösungsansätze von LIMS-basierten Datenmanagementlösungen [DOI: 10.1186/1756-0500-4-413] im Bereich der Sequenzierung, die Umsetzung der Anforderungen an FAIR-Prinzipien und die Herausforderung der Nutzung/Schulung der Nutzer aufgezeigt. Dazu gehören neben der Sicherstellung konsistenter, kurierter Daten auch harmonisierte, maschinenverarbeitbare Datenzugriffe zur Entwicklung von Webportalen, sowie die standardkonformen Datenpuplikationsprozesse, etwa zu den INSDC Datenbank ENA [DOI: 10.1093/nar/gkad1067] und BioSamples [DOI: 10.1093/nar/gkr937].

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